Stichting Steunpunt Avalon hanteert een bestuursstructuur bestaande uit een eenhoofdig bestuur. De bestuurder is Noa van Hagen, een ervaringsdeskundige met een achtergrond in jeugdzorg, verslavingszorg en geestelijke gezondheidszorg.

Zij combineert inhoudelijke deskundigheid met ervaring als ondernemer, kwaliteitsadviseur en organisator. De raad van toezicht bestaat uit drie leden met expertise in bestuur, financiën en zorg (jeugdzorg en ggz).